Имена игумений Ростовского Рождественско­го девичьего монастыря первых двух с поло­виной веков сегодня неизвестны. Лишь начи­ная с 1632 года история сохранила имена настоятельниц Ростовского девичьего монастыря. Среди игумений были выдающиеся монахини, запомнившиеся в истории обители благочестивой жизнью и особым радением об улучшении устройства монастыря, дома Пресвятой Богородицы.

Мария, упоминается под 1632 годом.

Параскева, упоминается под 1653 годом.

Марфа, упоминается под 1659 годом.

Ираида, упоминается под 1667 годом.

Наталия (Тяпкина), 1682–1722. Ее имя упомянул в своей книге «Розыск о брянской вере» святи­тель Димитрий Ростовский, ее знали ве­ликие государи Иоанн и Петр Алексееви­чи. Во время ее управления обителью, в 1680-е годы, был построен каменный собор Рождества Пресвятой Богородицы, в 1715 году собор был расписан. Монахинь при игумении Наталии было 90 человек. Матушка Наталия в 1684 году обраща­лась к великим государям Иоанну и Пет­ру Алексеевичам с прошением о расшире­нии территории монастыря и получила от них жалованную грамоту. Скончалась ма­тушка Наталия 20 июля 1723 года схимницей и погребена в стенах обители, которой посвятила всю жизнь.

Досифея (Щербакова), ок. 1721 — 1725. В миру Домна Дионисьевна Щербакова (1687 — 1725), дочь московского иконопис­ца Дионисия Ильича Щербакова. Монашеский постриг приняла в 15 лет, в августе 1702 года в Ростовском Рождественском монастыре, послушание — клиросное.

Мастридия (Тихменева), наместница, 1725–1728.

Христофора, 1728–1731. 22 июля 1732 года переведена настоятельницей в Троицкий, что на Бору, девичий монастырь, расположенный рядом с Борисо-Глебским монастырем в Ростовском уезде.

Ирина (Татарова), наместница, 1732–1733.

Есфирь, наместница, 1733 — 1736. В миру Евдокия Гавриловна Золотилова (год рождения — 1682), дочь помещика Романовского уезда. Монашеский постриг приняла в 1709 году в Рождественской обители, послушание — золотошвея. В 1736 году была разжалована в рядовые старицы.

Евдоксия, 1736 — 1754. В миру Екатерина (год рождения — 1681). Дочь крестьянина села Ильинское Рос­товского уезда. В монашество пострижена в феврале 1702 года в Рождественском монасты­ре. Пела на клиросе. В сан игумении возведена в 1736 году и управляла монастырем в течение 18 лет. По ее просьбе с 1742 года ежегодно совершался крестный ход с чудотворной Тихвинской иконой Божией Матери в Ярославль.

Измарагда, 1754 — 1779. В миру Ирина Яковлевна Володимирцева (ро­дилась в апреле 1705 года в Ростове), дочь певчего Ростовского архиерейского дома. По­стрижена в Рождественской обители в июне 1732 года, послушание — клиросное.

Августа, 1779–1794. Произведена в игумении из монахинь Рожде­ственского монастыря 31 октября 1779 года, по ее прошению в августе 1794 года уволена с должности.

Назарета, 1794–1808. В игумении Рождественского монастыря про­изведена в августе 1794 года из монахинь Мос­ковского Вознесенского монастыря. По ее про­шению уволена от должности в марте месяце 1808 года и переведена в Московскую епархию.

Павла I (Шатилова), 1809 — 1848. В миру Прасковья Яковлевна Шатилова (1765 — 1849), из рода дворян Шатиловых. В течение двадцати двух лет она подвизалась в разных мона­стырях, прежде чем архиепископом Ан­тонием была переведена в Ростовский Богородице-Рождественский монастырь, где через год, в 1809 году, была постриже­на в монашество и менее чем через месяц возведена в сан игумении. За сорок лет своего игуменства матушка Павла много сил положила на благоустроение и благоукрашение обители: была построена ко­локольня, два двухэтажных гостиных до­ма, надстроен второй этаж над келлиями. Но главным делом ее жизни было возве­дение в обители церкви в честь Тихвин­ской иконы Божией Матери. Современ­ники игумении Павлы отмечали исклю­чительную строгость и порядок, царив­шие в обители в те годы. Награждена наперс­ным крестом.  В мае 1848 года по своему прошению уволена с пенсией 28 рублей 59 копеек серебром. 15 ию­ня 1849 года в глубокой старости скончалась и погребена в Рождественском монастыре.

Павла II (Дьяконова, 1848 — 1869). В миру Прасковья Ивановна, мещанская дочь из города Мологи. С дет­ских лет воспитывалась в келлии своей предшественницы игумении Павлы Шатиловой сначала в Мологском Афанасьевском монастыре, а затем в Ростовской Рождественской обители, где в 32 года была пострижена в монашество. Через четыре года была определена на должность казначеи (по важности в жизни и деятельности монас­тыря эта должность была второй после должности игумении). 23 мая 1848 года была произведена в игумении. В игумен­ство матушки Павлы II при Рождественской обители была открыта школа грамоты для девочек из бедных семей.

Амфилохия (Политковская), 1869 — 1872. В миру Прасковья Алексеевна Политковская (1805 — 1888), дочь причетника. Воспитывалась и обучалась в ярославском Казанском девичьем монастыре. В 1830 году была определена в число послуш­ниц, а 15 августа 1850 года пострижена в мо­нашество. В течение 19 лет ее послушанием было пение на клиросе в Казанском монасты­ре. 19 июня 1869 года возведена в сан игуме­нии Рождественской обители; 22 января 1872 года перемещена на покой в ярославский Казанский монастырь.

Антония (Щепетильникова), 1872 — 1880. В миру Анна Ивановна (1828 — 1880) была доче­рью купца, потомственного почетного граж­данина Ярославля Иоанна Горшкова. Анна Иоанновна рано овдовела и с тремя детьми вернулась в родительский дом. В возрасте 35 лет Анна поступила в Рождественский монастырь. В 1872 году пострижена в монашество с именем Антония и назначена казначеей монастыря. В том же году в обители открылось вакантное местно настоя­тельницы, и сестры единогласно представили владыке кандидатуру Антонии. 30 августа 1872 года матушка Антония была возведена в сан игуме­нии. За годы ее настоятельства были отремонтированы верхний летний Рождественский собор и ниж­ний храм во имя Алексия, человека Божия, с устройством общей трапезы для сестер обители, а двухэтажный корпус вновь был переде­лан под жилые келлии. Тихвинский храм был украшен стенной живописью. Из главного настоятельского корпуса к летнему и зимнему храмам были устроены на каменных столбах глухие переходы со стеклянными окнами. Был построен новый двухэтажный корпус, в кото­ром устроено двенадцать келлий, вмещавших более пятидесяти сестер. Для монастырского духовенства (двух священников, дьякона и пса­ломщика) были куплены в собственность мо­настыря четыре деревянных дома. В обители по штату было положено 15 мона­хинь (помимо игумении и казначеи), матушка игумения внесла капитал на вечные времена еще на шесть сверхштатных монахинь. Во время управления обителью игуменией Антонией в монастыре проживало 170 сестер. Согласно их способностям все были разделены на разряды послушания: одни были певчими и приучаемые к пению (хор сестер Рождественской обители во все времена славился в епархии своим пением), другие занимались вышиванием, шитьем, третьи украшали иконы (фольгою, апплике, в серебро). По единодушному желанию всех сестер тело игумении Антонии погребено против алтаря Рождественского собора.

Мария (Чистова), 1880 — 1907. В миру Ольга Егоровна Чистова (1832 — 1907). Родилась в Ростове, в мещан­ской семье. Овдовев, отец отдал ее на воспита­ние в Ростовский Рождественский монастырь, когда ей не было пяти лет, а сам 27 февраля 1837 года принял монашеский постриг с именем Геннадий в Ростовском Богоявленском Авраамиевом монастыре (позднее был игу­меном Пошехонской Исаакиевской пустыни). В монастыре девочка обучалась чтению, пению, письму и рукоделию. Ольга рано начала петь на клиросе. В 1858 году она бы­ла определена послушницей в монастырь, где проходила клиросное послушание. 24 мая 1876 года Ольга приняла монашеский постриг с именем Мария. С 8 марта 1879 года была определена на должность казначеи. По едино­душному представлению сестер обители 29 ок­тября 1880 года была возве­дена в сан игумении.  Награждена наперсным крес­том. В 1891 году за устройство помещения для Рождественской церковно-приходской школы  утверждена попечительницей этой школы. Погребена за алтарем Рождественского собора.

Августа, 1907–1926 (?). Год рождения 1843. Назначена из монахинь Рождественской обители. Чин возведения мо­нахини Августы в сан игумении был совершен в Тихвинской церкви архиепископом Яро­славским и Ростовским Тихоном (Беллавиным, 1907–1913), будущим патриархом Московским и всея Руси. Она продолжала благоустройство обители на средства благотворителей. В годы ее управления обителью были проведены электричество и водопровод. Игумения была попечительницей церковно-приходской школы при Рождественской обители. На свои средства она покупала школьные пособия и другие необходимые вещи для бесплатной раздачи детям бедных родителей. Награждена золотым крестом.

Павла (Капитонова), 1997 — 2011. В миру Татьяна Ивановна Капитонова, роди­лась 12 ноября 1946 года. В 1993 году пришла послушницей в Свято-Введенский Толгский монастырь. В 1994 го­ду пострижена в иночество с именем Неофита, в 1997 году переведена настоятельницей в только что открывшийся Рождественский женский мона­стырь в Ростове. Тогда же инокиня Неофита приняла монашеский постриг с именем Павла, в честь апостола Павла, в 2001 году возведена в сан игу­мении. 30 мая 2011 года освобождена от обязанностей настоятельницы.